Concerns about antimicrobial use and phenotypic resistance pattern in pig nasal microbiome
Título alternativo
Considerações sobre uso de antimicrobianos via oral em porcas e perfil de resistência fenotípica no microbioma nasal de suínos
Autor(a)
Rigueira, Luciana Lana
Orientador(a) Coorientador(a)
Perecmanis, Simone||Aragón Fernández, Virginia
Data de aceite
2025-05-09
Data de disponibilizacao
2025-05-09
Data de publicacao
2025-05-09
Data de defesa submissao
2025-01-21
Citacao
RIGUEIRA, Luciana Lana. Concerns about antimicrobial use and phenotypic resistance pattern in pig nasal microbiome. 2025. 97 f., il. Tese (Doutorado em Saúde Animal) — Universidade de Brasília, Brasília, 2025.
Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2025.
Resumo Portugues
Este estudo foi dividido em duas partes, ambas com o objetivo de avaliar o fenótipo dos habitantes
da microbiota nasal suína. O primeiro estudo, realizado na Universidade de Brasília, consistiu no isolamento
de agentes bacterianos coletados de swabs nasais de 50 matrizes suínas alojadas em 10 granjas comerciais
com diferentes manejos sanitários no Distrito Federal, Brasil. Um total de 132 cepas cultivadas foram
caracterizadas. A suscetibilidade microbiana foi avaliada pelo método qualitativo de Kirby-Bauer e estimouse 55% de resistência antimicrobiana global (1573/2840 testes). Entre os 23 discos de antibióticos testados,
bacitracina exibiu maior resistência (92%). Pasteurella multocida foi detectada em 60% das granjas,
Glaesserella parasuis em 40% e Actinobacillus pleuropneumoniae em 10% das explorações. Não foi
detectada a presença de M. hyopneumoniae. Foi encontrada uma associação positiva entre a redução das
lesões no matadouro e a utilização de vacinas autógenas contra P. multocida (p=0,048). Agentes patogénicos
como Pseudomonas aeruginosa, Actinobacillus suis e Salmonella sp. foram as espécies consideradas mais
resistentes, mas não patogênicos, como Staphylococcus coagulase-negativo, também exibiram resistência.
O segundo estudo foi realizado no centro de pesquisa em saúde animal IRTA-CReSA. O método
quantitativo de suscetibilidade antimicrobiana utilizado foi a microdiluição em caldo pela técnica de
concentração inibitória mínima (CIM). Foi realizada a avaliação 56 estirpes obtidas a partir de isolados já
disponíveis no laboratório. Os valores de CIM foram determinados para 24 antimicrobianos. Entre os
antimicrobianos testados, a resistência fenotípica à clindamicina foi a mais frequente.
Tendo em conta a elevada prevalência de resistência antimicrobiana em agentes não patogênicos da
microbiota nasal de suínos tanto no Distrito Federal, Brasil quanto em Barcelona, Espanha, sugere-se que
agentes comensais também sejam testados e abordados no plano de resistência a antibióticos (PAN BR
AGRO, Brasil; PRAN, Espanha). Por fim, a inclusão de estudos de caracterização de agentes bacterianos
obtidos a partir de swab nasal de suínos, ampliando o escopo em curso, pode fortalecer o programa brasileiro
para o monitoramento de suscetibilidade microbiana na abordagem Saúde Única.
Resumo Ingles
This study was divided into two parts, both with the aim of evaluating the phenotype
of the inhabitants of the pig nasal microbiota. The first study at the University of Brasilia consisted in
isolating bacterial agents collected from nasal swabs of 50 sows housed in 10 commercial farms with different
sanitary management, located in the Federal District, Brazil. A total of 132 cultured strains were
characterized. Microbial susceptibility was evaluated using the qualitative Kirby-Bauer method with up to
23 antibiotic discs, with an overall antimicrobial resistance estimated at 55% (1573/2840 tests). Interestingly,
bacitracin, an antimicrobial no longer used in pig production, was found to be the most resistant (92%),
followed by florfenicol (76.5%). Molecular diagnosis was performed to confirm the presence of the most
common PRDC pathogens. M. hyopneumoniae was not detected. Glaesserella parasuis and Actinobacillus
pleuropneumoniae were not cultured but were detected by multiplex polymerase chain reaction (PCR) in
40% and 10% of the farms, respectively. Pasteurella multocida was cultured in half of the farms and detected
by PCR in 60% of the farms. A positive association was found between the reduction of lesions in the abattoir
and the use of autogenous vaccines against P. multocida (Fisher's exact probability test, P=0.048). Pathogens
such as Pseudomonas aeruginosa, Actinobacillus suis and Salmonella ser. Typhimurium were the most
resistant species, but agents of the commensal nasal microbiota, such as Staphylococcus coagulase-negative,
also exhibited antimicrobial resistance.
The second study at IRTA-CrESA evaluate antimicrobial susceptibility by broth
microdilution on 56 strains obtained from isolates already available in the laboratory, obtained from sow
vaginal swab (n=11), colostrum (n=9) and nasal swab samples from dams (n=15) and their litters (n=21).
MIC (minimum inhibitory concentration - MIC) values were obtained for 24 antimicrobials. Among the
antimicrobials tested, phenotypic resistance to clindamycin was the most common among the strains
evaluated.
Given the high prevalence of antimicrobial resistance in pigs in the DF, it would be
desirable to implement a national antimicrobial resistance surveillance program similar to the Spanish model.
On the other hand, considering the presence of antimicrobial resistance in commensals in pig samples in
Brazil and Spain, it is desirable that the inhabitants of the commensal flora are also included in the ongoing
microbial susceptibility monitoring.
Unidade academica
Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária (FAV)
Programa de Pos-Graduacao
Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal
Agencia financiadora
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).
Idioma
eng
Tipo de documento
Tese
Formato
application/pdf
Direitos de acesso
Acesso Aberto
Termo de licenca
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